CNR résistance aux antibiotiques
antibiogramme Test analyse_sequence

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Depuis le 01 janvier 2012, le CNR est coordonné par le Laboratoire de Bactériologie du Pr Plésiat (CHRU de Besançon).

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Modalités d’envoi des souches



Fiche de renseignements (Résistance)

Fiche de renseignements (Comparaison de souches)

 

Les entérobactéries productrices de carbapénèmase (EPC) restent rares en France. Elles doivent cependant être activement recherchées par les laboratoires de biologie médicale, publics ou privés, et faire l'objet d'un signalement (portail eSIN : Déclaration des BHRe).

1) Quelles souches adresser au CNR ?

Avec les développements récents des méthodes de détection des EPC, nombreux laboratoires sont en mesure de détecter efficacement et d’identifier les EPC. Cependant, dans le but d’évaluer l’ampleur des phénomènes épidémiques par rapport aux cas dits sporadiques et pour conserver une vision globale et actualisée de l’épidémiologie française (notamment pour adapter les tests diagnostiques), le CNR souhaite toujours recevoir rapidement la première souche suspecte d'EPC de chaque nouveau patient, quelle que soit l’espèce. Le CNR déterminera alors le génotype et identifiera (type et variant) l’enzyme produite par chacune de ces souches.

2) Modalités d’envoi des souches

a) Chaque souche envoyée au CNR devra être accompagnée d’un formulaire de demande (cliquez ici). Les renseignements demandés, et plus particulièrement les items surlignés en jaune, sont indispensables au bon enregistrement des souches.

L’accusé de bonne réception des souches et la diffusion des résultats se faisant par courriel, veuillez fournir une adresse email valide. Afin d’optimiser le rendu des résultats, nous vous conseillons d’utiliser une adresse email « générique » pour le laboratoire (accessible par l’ensemble des biologistes du laboratoire). Une adresse email « générique » sera toujours préférée à une adresse personnelle.

b) Les types de prélèvement acceptés sont : tube gélosé ou réisolement sur gélose correctement identifiée. Merci de nous faire parvenir des souches pures.

c) Les souches doivent être envoyées dans un triple emballage, selon la réglementation en vigueur pour le transport des échantillons infectieux.

 

3) Modalités d’expertise des souches et rendu des résultats

De façon générale, la procédure est la suivante :

a) Réception et enregistrement de la souche sur le serveur du CNR

b) Accusé réception de la souche par email

c) Résultats : disponibles 48h ouvrées après réception de la souche (si la souche est arrivée un vendredi, le résultat est disponible le mardi).

 - Souche non EPC : Vous recevrez un mail vous informant de la mise à disposition du résultat définitif sur le site (ce résultat comprend la recherche de carbapénèmase, la CMI colistine et la recherche de résistance plasmidique à la colistine de type mcr) ;

- Souche EPC : Vous recevrez un mail vous informant de la mise à disposition du résultat partiel sur le  site (ce résultat comprend le type de carbapénèmase identifié, la CMI colistine et la recherche de résistance plasmidique à la colistine de type mcr). Le séquençage du gène codant pour la carbapénèmase (variant exact) sera effectué le plus rapidement possible et vous serez destinataire du résultat DÈS SA DISPONIBILITÉ. Le délai de rendu des résultats définitifs peut prendre jusqu’à 3 semaines. Un nouvel email vous sera alors adressé, vous indiquant la disponibilité des résultats sur le serveur.

ATTENTION : Aucun résultat papier n’est envoyé depuis le 1er janvier 2018. L’ensemble des résultats est consultable via le serveur sécurisé du CNR (http://www.cnr-resistance-antibiotiques.fr). Merci de bien penser à vous munir de votre identifiant et mot de passe qui vous sont fournis à chaque fois qu’un résultat est mis en ligne.

 

4) Demande de comparaison de souches

Les compraisons de souches seront réalisées après accord préalable avec le CNR. Tout envoi de souches devra être accompagné du formulaire de demande spécifique.

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